Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GCAP28676 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCAP28676 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCAP28676 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms