Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms