Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBRP28336 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBRP28336 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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