Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms