Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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