Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACO1P21399 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACO1P21399 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms