Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFE3P19532 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFE3P19532 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFE3P19532 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFE3P19532 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFE3P19532 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms