Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPIP17213 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPIP17213 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms