Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF4P15884 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF4P15884 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms