Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH1P12830 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH1P12830 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms