Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RALAP11233 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RALAP11233 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RALAP11233 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms