Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms