Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APODP05090 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APODP05090 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms