Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPBO95292 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPBO95292 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPBO95292 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPBO95292 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPBO95292 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPBO95292 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPBO95292 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms