Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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