Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC9O60706 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC9O60706 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms