Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSI1O43347 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms