Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms