Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP73A6NFT4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms