Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435.5 ms