Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB5A4FU69 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB5A4FU69 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms