Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms