Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX7Q9UNH6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms