Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms