Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms