Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC180Q9P1Z9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms