Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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