Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SH3BP4Q9P0V3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SH3BP4Q9P0V3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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SH3BP4Q9P0V3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SH3BP4Q9P0V3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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