Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM5Q9NQX1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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