Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms