Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms