Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms