Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SMIM3Q9BZL3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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