Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms