Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms