Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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