Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms