Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms