Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms