Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIC2Q96JB3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms