Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF185Q96GF1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms