Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TM4SF18Q96CE8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TM4SF18Q96CE8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TM4SF18Q96CE8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TM4SF18Q96CE8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TM4SF18Q96CE8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TM4SF18Q96CE8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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TM4SF18Q96CE8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TM4SF18Q96CE8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TM4SF18Q96CE8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM4SF18Q96CE8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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