Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms