Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms