Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms