Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP4Q86YS3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms