Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
WDR53Q7Z5U6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
WDR53Q7Z5U6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
WDR53Q7Z5U6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
WDR53Q7Z5U6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
WDR53Q7Z5U6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
WDR53Q7Z5U6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
WDR53Q7Z5U6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms