Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APTXQ7Z2E3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APTXQ7Z2E3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APTXQ7Z2E3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms