Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SV2AQ7L0J3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms