Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF493Q6ZR52 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms